綱手回到木葉村，木葉基本恢復(fù)了以往的平靜，不同的是，幾乎所有的上忍都要出去執(zhí)行任務(wù)，其他下忍相對來說也比較忙，但是這些任務(wù)相對于鳴人來說意義不大，所以鳴人也有了自己的打算。
這一天，鳴人剛好來到綱手的火影辦公室，手中拿著這次任務(wù)的戰(zhàn)利品“雷神之劍”。這把劍原來屬于木葉村，是二代火影使用過的武器，本身具有強大的雷屬性查克拉，而且攜帶方便，雷屬性查克拉形成的劍刃可以收放自如。但是這把武器卻流落到了雨忍村的垃圾上忍“葵”的手中，葵根本就不會使用雷遁，實力也只能說勉強算個上忍，被鳴人解決之后奪回了雷神之劍。
就在鳴人向綱手匯報任務(wù)時，一個拄著拐杖，紗布蒙住右眼的人走了進來，正是根部的首領(lǐng)“團藏”。團藏看了鳴人一眼，接著目光轉(zhuǎn)向綱手道：“火影大人，正好鳴人也在，目前村子處于非常時期，暗部的任務(wù)非常多，作為村子里的天才忍者，旋渦鳴人只作為下忍實在是浪費，希望火影大人能夠批準讓他加入根，在那里相信鳴人可以得到更快的成長”。
聽到團藏這話，綱手很清楚團藏的目的，臉上透露出不快道：“不行，鳴人不是一般的忍者，為了他的安全起見，絕對不能讓他加入根?！?p> 團藏道：“根本來就有很多天才忍者，而天才不僅要能夠在陽光下成長，也要有適當?shù)膲毫??！?p> “讓我加入暗部吧，火影大人”鳴人道。
團藏不由一喜：“既然鳴人也愿意的話，那么火影大人......“
“但是，我要加入的是火影直屬的暗部，而不是根”鳴人道
聽到這話，團藏深深的看了鳴人一眼道：“鳴人，人總是要為自己的選擇擔(dān)負責(zé)任的，希望你能夠早一點明白?！罢f完，轉(zhuǎn)身離開了火影的辦公室。
見到團藏離開，綱手則是對鳴人擔(dān)憂道：“鳴人，你真的想好了嗎？暗部不是你想象中的那么簡單，你將面臨很多血腥和殘忍的事情，以你現(xiàn)在的年紀還不適合?！?p> “你放心吧，綱手婆婆，加入暗部也是我想了很久才做出的決定”，鳴人道。
接著，鳴人推了推頭上的護額道：“火影大人，作為木葉的忍者，我肯定是要為木葉做出自己最大的貢獻。但是，我還有一個要求，為了隱藏我的身份，我希望第七班有重要任務(wù)的時候我還是要盡量一起執(zhí)行。
綱手道：”這樣也好，我同意了。“
其實，這個決定鳴人也是想了很久才這么做的，加入暗部可以有很多更有挑戰(zhàn)性的任務(wù)，同時也便于和別國的忍者交手，這樣就能多解決一些別國的強大對手，為鳴人將來要做的那件事情做準備。在暗部有了一定的地位之后也會更加自由。為此，鳴人也是做足了準備。
首先，通過向卡卡西等人學(xué)習(xí)，更熟練的使用雷遁，也開始了水遁的修行，同時還奪得了雷神之劍作為更趁手的武器。買了一套黑色的衣服和披風(fēng)，作為暗部的專有打扮。
和明面上的忍者一樣，暗部也是有組織的，同樣也會為了任務(wù)而組建小隊，但是更加隱蔽，如果在任務(wù)中死亡的話，為了高度保密，連尸體都不允許留下。鳴人才剛剛加入暗部，暫時沒有加入小隊，只能進行單獨的任務(wù)。而綱手給鳴人的第一個任務(wù)是，找機會暗殺一個巴之國的大名，發(fā)布任務(wù)的是另一個大名的繼承人。
由于巴之國的這位大名剛剛繼位，如果出現(xiàn)意外的話就會另外選擇繼承人。但是這樣的事情并不能做得很光明正大，要做得很像是意外的情況，而且不能有任何把柄。木葉之所以接下這個任務(wù)完全是因為對方愿意付出高額的酬勞，在目前這種情況之下，木葉需要大量的費用，其他方面的問題也只能暫時不去考慮了。
任務(wù)要求，殺死巴之國大名，不留下任何證據(jù)，不管用什么手段都可以。幾乎任何國家都會有忍者，只是數(shù)量的多少以及精通的忍術(shù)不一樣，但是不管如何，在這種時期大名身邊肯定會有大量的忍者保護。不過任務(wù)的關(guān)鍵只要殺死大名倒是有了很大自由發(fā)揮的空間。
接到這個任務(wù)，鳴人首先要通過變身術(shù)了解大名的行蹤，經(jīng)過幾天的調(diào)查，鳴人得知大名每一次外出都要帶大量的護衛(wèi)，其中忍者不下二十人，其中還有上忍。至于在大名府內(nèi)部的情況就不太清楚了。對于這種情況鳴人心中也有了計較。
兩天以后，大名要出行道一個比較遠的地方去，帶著大量護衛(wèi)前往，但是是一個遠離城市的地方，行進到半路，一個人擋在路中間。這人穿著一身黑衣，黑色的披風(fēng)剛好拖到地上，個子不是很高，頭上戴著面具，沒有辦法判斷年齡和身份，這人正是以暗部身份執(zhí)行任務(wù)的鳴人。
走在最前面的護衛(wèi)大聲喊道：“前面那個人，趕緊滾開，沒看見是大名的車隊嗎？”
鳴人依舊站在那里，仿佛沒有聽見，咳嗽一聲，裝作很老成的聲音道：“你就是巴之國新任的大名吧，一看就沒什么才干，連手下怎么講話都沒有教會，難怪有人想要你的命，你去死吧?！?p> 車上的大名聽到鳴人的話哈哈大笑：“你就是那家伙派來殺我的刺客吧，作為刺客如果采取暗殺的方法可以說是防不勝防，沒想到居然這么白癡，難道你想憑一個人打敗我們這么多人嗎？大家把他圍起來，抓活口”
鳴人依舊站在原地，亮出雷神之劍。帶頭的上忍見到雷神之劍，馬上提高了警惕，對周圍的人道：“大家小心，這個人不是一般的忍者?！?p> 就在眾人聽到這話的同時，只見雷神之劍亮起雷屬性的查克拉，同時鳴人身上也浮現(xiàn)出查克拉，就好像一道閃電劃過，幾十個人的腦袋就搬家了，只有那兩位上忍擋住鳴人一刀，但是身上也被雷電擊中，倒在地上。鳴人，手持雷神之劍，緩緩走過去道：“到底是小國，就連上忍也只有這種程度的實力嗎？”兩道雷光閃過，結(jié)果了兩人的性命。
鳴人轉(zhuǎn)過身來看向車上的大名，只見這大名癱倒在車上，完全沒有了剛才的氣勢，嘴里不停的叫著：“妖怪，妖怪。。?！兵Q人走上前去道：“無論是智慧還是力量都不怎么樣，單單只是因為父母的原因就可以繼承大名的位置，即使穿上了高貴的衣服也改變不了垃圾的本性?！?p> 說完只聽到一聲慘叫。